为菟丝子的滋补作用，制药及临床需要量大，而其产量又低，产生了供求失衡现象。所以菟丝子是各个药材市场上抽检不合格率高的品种之一。混淆品，伪品层出不穷。

常见掺假现象：1.用苋科苋属千穗谷的种子（别名籽粒苋），圆小,边缘薄中间鼓，形如飞碟。黄白色或红黑色,千粒重0.5克左右。经染色掺入。

2.伪造品的原料也由细泥砂造伪，转变成现在的由淀粉、胶、细泥砂、其它植物细粉、色素加工制成。与由全泥砂的伪品相比，这种伪品的单位重量所含颗粒数、颜色、手感、更接近正品菟丝子，更具欺骗性。由伪品加少量正品菟丝子的现象时有发生。

3.菟丝子：掺假者用小苏子掺入菟丝子。鉴别：用放大镜观察，每粒菟丝子上均有肚脐状的凹陷，假的没有。用水煮，可以观察到菟丝子吐丝发粘。

菟丝子正品与伪品的理化鉴别：分别取菟丝子与伪品，置粗试管中，加沸水浸泡，菟丝子表面有黏性，水溶液淡棕色，加热煮至种皮破裂，可露出黄白色卷旋状的胚，形如吐丝。伪品水浸液淡棕黄色至深棕黄色或淡绿色(取决于所用色素的颜色)。颗粒膨大，变成灰白色、淡绿色。但并不破碎(区别于泥砂伪品)久泡加热无黄白色卷旋状的胚露出。

正品放大镜下观察表面有细密深色小点，一端有微凹的线形种脐，用硬物挤压正品成片状，不容压碎，。伪品呈粉状或颗粒状。